생산성 향상, 폐기물, 품질개선을 위하여 생물질을 분리, 정제, 회수하는 공정을 연구한다.

회수공정 설계시 폐수의 발생을 억제할 수 있도록 공정을 개선하고 발효액에서 균체를 어떻게 회수할 것인가를 연구한다. 균체를 회수하기 위하여 원심분리나 여과(filtering)방법을 사용한다. 균체를 파쇄하여 적정 버퍼(buffer solution)에 풀어 다양한 흡착, 제거 수지를 통과 처리하여 물질을 추출하고 농축한 후 여과하여 건조하여 결정을 추출한다. 전체적인 분리 과정의 각 요소를 조절하고 변형하여 효율적인 분리 방법을 연구한다. 전자현미경사진을 이용하여 입자의 입도 분석을 하고 색상, 색도의 제거 또는 착색의 공정을 연구하기도 한다. 실제 공정에 응용하기 전에 예비 실험을 하기도 한다.