우수한 품질의 가축 및 가금을 생산하기 위하여 축산개량계획을 수립하고 유전자원 보전, 질병예방, 품종 선정 및 보급 등에 관한 기술을 개발하기 위한 연구를 한다.

가축 및 가금에 대한 개량계획을 수립하고, 개량 방향 및 목표를 설정한다. 가축 및 가금의 유전관련 자료를 수집하고 유전능력 분석시스템을 개발하여 정확한 유전능력 평가자료로 활용한다. 가축 및 가금의 유전보존 및 이용기술을 확립하고, 수정란 이식 및 인공수정 실용화기술의 개발을 위한 연구를 한다. 가축 및 가금의 질병예방 및 치료효과 증대를 위한 저비용 치료기술을 개발한다. 한우, 육우 및 젖소의 품질개량 및 능력검정, 사양관리 등에 관한 기술개발을 위한 연구를 한다. 한우, 육우 및 젖소에 대한 심사·선발, 생산 및 보급에 관한 기술개발과 생산·보급체계 설정에 관한 연구를 한다. 한우, 육우 및 젖소에 대한 경영기술, 사육자동화, 사료이용 효율의 증진, 품종보존 및 생산 등에 관한 연구를 한다. 돼지, 토끼 등의 중소가축의 품종개량과 능력검정 등에 관한 연구를 한다.