한반도 주변해역과 북서태평양의 해양물리적 특성을 조사하고 해수순환과의 역학구조를 규명하며, 해양환경보전 및 기후환경변화와 해양음성특성을 규명하기 위한 연구를 한다. 주변해역의 해양 화학적 특성을 규명하고 해양생물로부터 신물질을 개발하기 위한 연구를 한다. 해양생태계 구성요인의 시·공간적 변화와 이들간의 상호관계를 규명하고 해양생물환경보전, 해양생물자원의 합리적 관리기법, 생물공학을 이용한 유용생물의 생산성 향상에 관한 연구를 한다. 해양지질환경의 진화와 해저자원 개발을 위한 기초 및 응용과학에 대한 조사·연구를 한다. 해양에너지 자원 및 공간자원의 개발과 이용에 관련된 공학기술을 연구·개발하고, 연안환경요소의 변화양상 및 예측기술을 개발한다. 연안재해 예보 및 방제 기술을 개발한다.