작물에 발생하는 병해를 조사·분석하고 평가한다. 식물병원균의 분류·동정(생물의 속명이나 종명을 결정하는 것) 및 병해진단에 관한 연구를 한다. 작물에 발생하는 각종 병의 생리, 생태 및 역학에 관한 연구를 한다. 병·약제에 대한 작물의 저항성에 관한 연구를 한다. 작물에 발생하는 병의 종합방제를 위한 기술을 개발한다. 우수 살균제의 선발 및 사용방법에 관한 결과를 도출하기 위하여 시험 및 연구를 한다. 식물생장조절 및 생리활성물질의 개발 및 이용에 관한 연구를 한다. 잡초의 분류·동정·발생분포 및 방제에 관한 조사와 연구를 한다. 우수제초제의 선발 및 잡초 종합관리기술을 개발하기 위한 연구를 한다. 작물의 보호에 관한 국제협약에 대한 연구를 한다.