버섯의 종류에 따라 톱밥을 선택한다. 균사의 발육을 억제하기 위하여 미강에서 지방성을 빼어낸 탈지강을 준비한다. 톱밥배지의 충전도·종균저장기간·종균제조기간에 따라 배지의 수분함량을 조절한다. 초자병에 자동주입기를 사용하여 일정량의 배지를 넣고 산소공급을 원활하게 해주기 위하여 배지 중앙에 압봉으로 구멍을 뚫어준다. 고압습열균기로 고온처리하여 멸균시키고 급냉 시킨다. 살균된 배지에 잡균의 오염을 방지하기위하여 알콜램프·핀셋트·수갑·마스크·가운·위생모 등을 착용하고 무균접종실에서 균사를 배지 중앙에접종한다. 접종이 완료된 배지를 소독처리된 항온실에서 잡균을 검사하고 균사를 발육시켜 종균을 생산한다.