전국 연근해역의 해양환경을 모니터링하고 연안어장 환경회복 및 적정관리에 관해 연구한다.

바다의 해양오염측정망에서 해양오염을 측정한다. 고분해능 질량분석기, 가스크로마토그라프, 원자흡광광도계, 자동수온분석기, 초음파 분해장치 등을 사용하여 다이옥신 및 관련 화합물 분석, 유해유기오염물질의 성분 확인, 해수, 해적퇴적물, 해양생물 중의 미량원소 분석, 해저퇴적물 및 입자물질 중의 산분해 및 완전분해 등을 분석한다. 어장환경의 적정관리 기술에 관해 연구한다. 어장환경 개선기술에 관해 연구한다. 유해물질의 생물의 영향에 관해 연구한다. 환경기준 설정에 관해 연구한다. 해양환경 공정 시험법에 관해 연구한다. 어장환경 평가 및 제어에 관해 연구한다. 기타 연구원(일반)들이 수행하는 일반적인 활동을 한다.