침지조 조정판에 침지시간, 황산용액의 양, 온도 등을 입력한다. 황산용액 저장탱크의 유량을 확인하고 침지탱크에 일정량의 옥수수와 황산용액이 제대로 투입되는 지 확인하고 조정판을 조작해서 유량을 조절한다. 침지조에 투입된 옥수수와 황산용액을 가열하기 위하여 증기밸브를 열고 재킷(jacket)이나 순환관에 증기를 투입한다. 일정 시간동안 침지한 후 견본을 채취하여 수분함유량, 황산의 농도 등을 검사하여 제품표준과 비교한다. 침지가 완료되면 용액배출밸브를 열어 황산용액을 저장탱크로 이송한다. 침지탱크의 하부배출 밸브를 열어 파쇄공정의 저장호퍼로 침지된 옥수수를 이송한다.