여과된 당액의 불순물(냄새, 색)을 정제하기 위하여 입상활성탄이 충진된 흡착탑을 조작·관리한다.

흡착탑 내부에 적적량의 입상활성탄을 충진한 후 예열시킨다. 원당여과기를 통과한 여과액(당액)이 흡착탑을 통과하도록 펌프를 작동시켜 당액의 불순물을 입상활성탄에 흡착시킨다. 흡착이 잘 이루어지는지를 수시로 검사하고 흡착탑 내부의 이물질을 제거하며 흡착율이 떨어지는 입상활성탄을 교체한다. 흡착이 완료된 당액을 펌프를 이용하여 세라믹 여과공정으로 이송한다. 자동화된 기계의 조정판에 용액의 투입량, 흡착탑의 온도 등을 입력하여 정제되는 과정을 관찰·조절하기도 한다.